药师咒和药师心咒看起来是很相似的，但是它们是不同的咒语，内容上就很不相同。以下就是药师咒和药师心咒的原文，大家可以通过原文的内容简单比较一下它们之间的不同。

药师心咒：

喋 雅 他嗡，贝 堪 则贝 堪 则，玛哈

贝 堪 则，拉杂萨目，嘎喋 梭哈。

药师咒：

南谟薄伽伐帝。鞞(Pi)杀社。窭(jv)噜薜琉璃。钵喇婆。喝罗(la)闍也。怛他(Tuo)揭多耶。阿罗(La)喝帝。三藐三勃陀耶。怛侄他(Tuo)。唵。鞞(Pi)杀逝。鞞(Pi)杀逝。玛哈鞞(Pi)杀社。三没揭帝莎诃。

药师咒和药师心咒除了在内容上不同，意义上也有些不同。念诵药师咒的功德非常大，不仅能消除人们的病苦，还可以延年益寿。药师心咒是包含药师佛十二誓愿的咒语，在药师经原文中也有记载。

虽然药师咒和药师心咒之间存在不同，但是不管我们念诵药师咒还是药师心咒，都会有很多的功德利益，如果我们对咒语的深意能有更多的感悟，不仅能帮助自己开阔自己的内心，也能使得人们知道怎么修行，怎么去利益众生和自己，如果每个人都能为众生的利益付出，功德自然更多。